68 편의 논문
이 논문은 Pichia pastoris 에서 나노바디 기반 바이오센서와 이중 베이스 편집기를 결합한 BINDER 전략을 통해 재조합 단백질 분비 효율을 극대화하는 핵심 단일염기 변이를 발굴하고, 이를 통해 인간 혈청 알부민 생산량을 기록적인 23.43g/L 수준으로 향상시켰음을 보고합니다.
이 논문은 SNAP 태그와 인테인 매개 단백질 스플라이싱 반응을 결합하여 살아있는 세포 내에서 5 kDa 크기의 형광 펩타이드를 효율적으로 부착하는 새로운 바이오오르토고날 표지 기술인 CLUSTER 를 개발하고, 이를 최적화 및 기작 규명하여 단백질 연구에 혁신적인 도구를 제시했습니다.
이 연구는 단일 기관 연구의 한계를 극복하고 임상 전환 가능성을 높이기 위해, CCR8 과발현을 통한 CAR T 세포의 고형종 침투 향상 효과를 검증한 최초의 다기관 전임상 확인 연구의 실행 가능성과 표준화 전략을 입증했습니다.
이 논문은 브라우어 고정점 정리를 기반으로 한 기하학적 접근법과 구간 기반 도달성 분석을 결합하여, 비선형성과 고차원성으로 인해 증명하기 어려웠던 생체 분자 발진기 모델에서 극한 주기 (limit cycle) 의 존재성을 증명하고 그 영역을 엄밀하게 국소화하는 방법을 제시합니다.
이 논문은 CRISPRi 기반 고처리량 스크리닝을 통해 E. coli 의 라이코펜 생산성을 조절하는 31 개의 유전자를 체계적으로 규명하고, 대사 경로 전반에 걸친 생산성 향상을 위한 새로운 유전적 표적을 제시했습니다.
이 연구는 분할 GFP 보고 시스템과 CRISPRi 를 결합한 정량적 접근법을 통해 시아노박테리아에서 이종 효소의 약 50% 가 분해됨을 규명하고, 유전자 요소 최적화보다 동종 효소 대체가 발현 문제 해결에 더 효과적임을 보여주어 광합성 세포 공장 생산성 향상을 위한 기초 데이터를 제공했습니다.
이 논문은 명시적인 다중 서열 정렬 없이 생성 흐름 네트워크 (GFlowNets) 를 활용하여 시퀀스 생성과 계통수 탐색을 동시에 수행하는 'AncestorGFN'을 제안하고, 이를 통해 계통 발생 구조를 포착하고 새로운 시퀀스를 설계할 수 있음을 입증합니다.
이 논문은 단백질 서열을 동일하게 유지하면서 DNA 서열 간의 공유 서열을 최소화하여 합성 생물학의 안정성을 높이는 SIRIUS라는 정수 선형 프로그래밍 기반의 최적화 알고리즘을 소개하고 그 유효성을 입증합니다.
이 논문은 효모의 98 개 인터제닉 영역을 정량화하고 YeIP 라는 예측 모델을 개발하여 프로모터나 유전자 복사 수를 변경하지 않고도 유전체 통합 부위 선택만으로 대사 경로의 전사적 화학량론을 최적화할 수 있음을 입증했습니다.
이 논문은 자연어 처리 및 대규모 언어 모델을 활용하여 PubMed 문헌에서 CAR T 세포 신호 전달 관련 상호작용을 자동으로 추출하고 지식 그래프로 구축함으로써 차세대 키메라 항원 수용체 (CAR) 설계를 위한 체계적인 지식 기반을 마련한 연구입니다.
이 논문은 사물인터넷 (IoT) 과 DNA 사물 (DoT) 의 특성을 결합한 'InfinMark' 프레임워크를 통해 정보 DNA 나노입자를 활용한 종단간 양모드 위조 방지 시스템을 개발하여 생산부터 추적까지 전 과정의 안전한 인증을 가능하게 했음을 제시합니다.
이 논문은 DNA 기반의 프로그래밍 가능한 핵 모방 구조체 (Protonuclei) 를 도입하여 FUS 단백질의 상분리가 세포 환경의 복잡성 (혼잡도, 공간적 구속, 점탄성 등) 에 민감하게 반응함을 규명하고, 기존 시험관 내 실험으로는 예측할 수 없는 거동을 포착하여 질병 관련 고체화 현상을 조절할 수 있음을 보여주었습니다.
이 논문은 배양 단계에 따라 변화하는 세균의 생리적 상태를 고려하여 고정 이득 제어기의 한계를 극복하고, 이득 조정 (Gain-Scheduling) 기반의 피드백 및 피드포워드 제어 전략을 통해 배양액 내 유전자 발현의 외란을 효과적으로 억제하는 다중 스케일 모델 기반 제어 프레임워크를 제안합니다.
이 연구는 분열효모의 rpb9 유전자를 인간 POLR2I 로 대체한 시스템을 통해 두 단백질이 성장, 노화, 스트레스 반응, 이질염색체 형성 및 항암제 내성 등에서 기능적 보존성을 공유하지만, 특정 전사 억제제 내성에서는 종간 차이가 있음을 규명했습니다.
이 논문은 대장균의 표면 표시와 X174 박테리오파지를 결합한 SurPhACE 시스템을 통해 기존 항체 개발 방식의 한계를 극복하고, 소규모 배지에서 고처리량으로 나노바디를 진화 및 선별할 수 있는 새로운 플랫폼을 제시합니다.
이 논문은 VVD 도메인과 링커 영역을 표적 변형하여 광활성화 동역학과 역동적 범위를 개선한 향상된 LightR 변이체를 개발함으로써, Src 키나아제와 같은 단백질의 지속적 활성화부터 가역적·신속한 조절까지 다양한 광유전학적 응용을 가능하게 했음을 보고합니다.
이 논문은 정량적 중합효소 연쇄반응 (qPCR) 을 활용하여 DNA 나노구조 내 개별 리게이션 반응의 효율을 정량적으로 분석하고, 효소 도킹 확률에 따른 가장자리와 내부 부위의 반응성 차이를 규명하여 DMSO 용매 조건에서 이를 완화할 수 있음을 보임으로써 DNA 나노구조의 실용화를 위한 중요한 통찰을 제공했습니다.
이 논문은 항-CRISPR 단백질을 활용한 선택 압력을 통해 인간 세포 내에서 CRISPR-Cas9 시스템을 직접 진화시키는 새로운 플랫폼인 'CRISPR-MACE'를 개발하여, Cas9 의 DNA 결합 능력 향상 및 강력한 억제제인 AcrIIA4 에 대한 저항성 획득 등 기존 박테리아 기반 방식으로는 달성하기 어려웠던 기능 개선이 가능함을 입증했습니다.
이 논문은 AAV 캡시드에 스파이태그를 도입하고 호밍 단백질과 공유결합하여 표적 수용체를 인식하도록 프로그래밍 가능한 'MATCH'라는 모듈형 생화학 방법을 개발함으로써, AAV 의 tropism 을 정밀하게 제어하고 T 세포 및 뇌 조직 등 특정 조직으로의 전달 효율을 획기적으로 향상시켰음을 보고합니다.
이 논문은 synNotch-CAR T 세포의 신호 전달 및 유전자 발현을 정량화하는 수학적 모델을 개발하고 민감도 분석을 통해 결합 친화도, 프로모터 강도, 분해율 등 치료 효과를 동적으로 조절할 수 있는 핵심 공학적 표적들을 규명했습니다.